Programme des cours 2022-2023
| BMED0066-1 | |||||
| Organismes 2, Bactériologie médicale et TP Microbiologie appliquée 1 | |||||
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Durée :
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| 36h Th, 36h Pr | |||||
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Nombre de crédits :
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Nom du professeur :
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| Christelle Devillé | |||||
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Langue(s) de l'unité d'enseignement :
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| Langue française | |||||
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Organisation et évaluation :
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| Enseignement durant l'année complète, avec partiel en janvier | |||||
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Unités d'enseignement prérequises et corequises :
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| Les unités prérequises ou corequises sont présentées au sein de chaque programme | |||||
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Contenus de l'unité d'enseignement :
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| L'UE Organismes 2 (Bactériologie médicale et TP Microbiologie appliquée) aborde, tant au niveau théorique que pratique, les principales bactéries impliquées en pathologie infectieuse humaine, ainsi que les nombreuses méthodes de diagnostic utilisées dans les laboratoires de biologie médicale. L'accent est mis sur la démarche diagnostique. Les TP permettent aux étudiants de mettre en pratique les techniques développées au cours théorique et de s'exercer à la démarche d'identification (de la réception du prélèvement à la remise des résultats). Partie théorique : Bactériologie médicale Chap. 0 : Organisation & contenu Chap. 1 : Introduction et rappels Chap. 2 : Sécurité au laboratoire de bactériologie clinique Chap. 3 : Diagnostic des infections Différents prélèvements - Méthodes de diagnostic (recherche directe / indirecte) : caractères phénotypiques, tests rapides, milieux de culture, systèmes automatiques, spectrométrie masse, identification antigénique, diagnostic moléculaire, sérologie bactérienne, .... - ATBgramme Chap. 4 : Qualité et accréditation Chap. 5 : Maladies infectieuses par système / prélèvements : peau, œil, SU, SG, SD, SR, SN, maladies systémiques, liquide de ponction Rappels anatomiques - flore microbienne - démarche diagnostique Systémique bactérienne : propriétés (morphologie, coloration, culture, propriétés biochimiques, habitat, transmission, PP, facteurs de pathogénicité, diagnostic, prévention, traitement) Bactéries : Streptococcus, Enterococcus, Staphylococcus, Neisseria, Corynebacterium, Listeria, Entérobactéries, Bacilles Gram- de l'environnement, Haemophilus, Bordetella, Bacilles Gram- d'origine animale, Legionella, Vibrio, Campylobacter, Helicobacter, Mycobactéries, Clostridium, Bactéries spiralées, Bactéries diverses, ... Partie pratique : TP Microbiologie appliquée 1 Rappel : Consignes de sécurité et bonne pratique dans un laboratoire de microbiologie - Préparation du poste de travail - Utilisation d'un microscope pour l'observation de microorganismes - Observations macroscopiques de colonies - Réalisation de frottis et de coloration (examen à frais, BM, Gram, ....) - Différentes techniques d'ensemencement Utilisation de milieux sélectifs et différentiels dans un but d'identification, dont géloses chromogènes Analyses d'échantillons (urine, peau, SG, VR, selles, hémoculture, ...) - identification bactérienne (analyses microscopiques, culture, tests biochimiques, galeries biochimiques API, tests immunologiques pour la recherche d'Ag, ...) |
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Acquis d'apprentissage (objectifs d'apprentissage) de l'unité d'enseignement :
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| Décrire les propriétés générales des organismes procaryotes, leurs conditions de culture, les moyens physiques et chimiques permettant leur élimination ou l'inhibition de leur croissance
Définir et décrire de manière précise et scientifique les maladies infectieuses, les principales bactéries pathogènes chez l'Homme et les principales méthodes de diagnostic utilisées au laboratoire de bactériologie Différencier les bactéries commensales des bactéries pathogènes Appliquer les règles d'hygiène et de sécurité dans les différents types de laboratoires. Trier correctement les déchets issus des laboratoires Utiliser l'appareillage courant du laboratoire de microbiologie Mettre en œuvre les méthodes expérimentales et les techniques de microbiologie Analyser, interpréter et présenter les résultats obtenus. Mettre en pratique les connaissances théoriques pour comprendre les analyses et leurs résultats afin d'aboutir à un diagnostic Mettre en relation la théorie et la pratique Suivre un mode opératoire et le mettre en œuvre Rédiger un rapport Manipuler dans des conditions aseptiques. Réaliser les gestes précis et adéquats exigés par la manipulation de matériel infectieux Réaliser, de manière autonome, les expériences aboutissant aux diagnostics microbiologiques Comparer les techniques d'analyses entre elles en mettant en avant leurs avantages et inconvénients Choisir les milieux de culture, les conditions de cultures et les tests adéquats pour aboutir à un diagnostic bactériologique Mettre en place une démarche diagnostique logique pour les différents types d'échantillons pouvant être rencontrés dans un laboratoire de Microbiologie, en basant ses choix sur les avantages/inconvénients/ limites de chaque technique Compétences du référentiel liées à cette AA : C1 (1.3, 1.5 et 1.6), C2 (2.1, 2.2 et 2.3), C3 (3.4), C4 (4.1, 4.2, 4.3 et 4.4), C5 (5.1, 5.2 et 5.4), C6 (6.1, 6.2, 6.3 et 6.4) |
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Savoirs et compétences prérequis :
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| Unité pré-requise : TP Microbiologie générale Notions d'anatomie, d'immunologie (Ag, Ac, techniques ...), de biotechnologie Cours d'Hygiène (pictogrammes de sécurité, EPI, ES, risques biologiques, ...) et de Microbiologie générales (UE-Organismes 1) Règles de bonnes pratiques en laboratoire et règles de base pour le laboratoire de microbiologie Unités de volume Utilisation d'un microscope et des micropipettes Calcul de dilutions |
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Activités d'apprentissage prévues et méthodes d'enseignement :
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| Cours ex-cathédra Travaux pratiques - activités en laboratoire en autonomie Exercices dirigés Résolution de problèmes et de cas cliniques Démarche diagnostique Observation de pratiques |
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Mode d'enseignement (présentiel, à distance, hybride) :
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| Présentiel et à distance (classe inversée) | |||||
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Lectures recommandées ou obligatoires et notes de cours :
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| Documents à télécharger sur MyHeCh Obligatoires : notes de cours partielles (TP Microbiologie appliquée), documentations, protocoles, modèles de rapport (à imprimer en recto pour chaque séance), programme des TP et du cahier de TP* Cahier de laboratoire (obligatoire / en ordre - à toutes les séances de TP) - à préparer pour chaque séance selon le programme et les consignes fournies* Fortement conseillées : Chagneau et al. (2022) Bactériologie et virologie pratique - 4ème édition (De Boeck) Bianchi V. et al. (2019) Bactériologie Virologie - 2ème édition (De Boeck Supérieur) Béraud (2014) Le technicien d'analyses biomédicales (Lavoisier) Autres sources : 3ème édition du précis de Bactériologie clinique (2019) (ESKA) Raven et al. (2017) Biologie (De Boeck) Prescott L., Harley J. & Klein D. (2013) Microbiologie (De Boeck) Nauciel C. & Vildé J.L. (2005) Bactériologie médicale (Masson) Tortora G.J., Funke B.R., Case C.L. (2003) Introduction à la microbiologie (ERPI, Renouveau pédagogique) Microbiology Manual 12th Edition - Merck (livre + CD) http://www.microbes-edu.org/ |
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Modalités d'évaluation et critères :
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| L'unité est réussie avec une note minimale de 10/20. La présence à chaque séance de TP est obligatoire. Toute absence non justifiée par un document officiel (ex: certificat médical, certificat de décès d'un membre de la famille, ...) dans les 5 jours ouvrables sera sanctionnée d'un 0. En fin d'année, en cas d'un nombre d'absences trop important, même justifiées, l'enseignant peut estimer que l'étudiant n'a pas acquis les connaissances et savoir-faire suffisants. L'étudiant qui ne dispose pas de son matériel, du cahier de TP en ordre, des documents pour la rédaction des rapports, qui arrive en retard (au-delà de 15 minutes) peut être exclu de la séance de TP (0 à la séance). Une préparation individuelle complète conditionne l'accès au laboratoire, un « test d'entrée » peut être organisé en début de manipulations pour vérifier sa bonne réalisation. Evaluations formatives (0%) Chaque partie doit être réussie avec un minimum de 8/20 pour que le cours soit réussi. La note finale est une moyenne pondérée à condition d'avoir au minimum 8/20 pour chaque partie (théorique/pratique), si une des notes est inférieure à 8/20, la note finale correspondra à cette note. Evaluations sommatives :
20% pour l'examen pratique L'examen pratique n'est organisé qu'une seule fois par année académique (7ème séance)
40% pour l'examen (oral et/ou écrit) ATTENTION : La partie pratique n'est pas améliorable entre les 2 sessions. |
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Stage(s) :
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Remarques organisationnelles :
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Contacts :
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| Christelle Devillé
christelle.deville@hech.be |
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