Programme des cours 2018-2019
BMED0048-1  
Sciences biomédicales 6
  • Microbiologie : parasitologie et virologie
  • Sécurité et hygiène
Durée :
Microbiologie : parasitologie et virologie : 55h Th
Sécurité et hygiène : 20h Th
Nombre de crédits :
Bachelier : technologue de laboratoire médical - option : chimie clinique5
Nom du professeur :
Microbiologie : parasitologie et virologie : Olivier Waroux
Sécurité et hygiène : Sandra Florquin
Coordinateur(s) :
Sandra Florquin
Langue(s) de l'unité d'enseignement :
Langue française
Organisation et évaluation :
Enseignement au premier quadrimestre, examen en janvier
Unités d'enseignement prérequises et corequises :
Les unités prérequises ou corequises sont présentées au sein de chaque programme
Contenus de l'unité d'enseignement :
Microbiologie : parasitologie et virologie
Résumé:
Le cours de Microbiologie de 3ème Bac est divisé en 3 parties : virologie, parasitologie et mycologie.
La partie Virologie décrit dans un  premier temps les généralités concernant les virus : structure, constitution chimique, morphologie, multiplication virale, moyens de défense, techniques de diagnostic. La seconde partie aborde les principaux virus et maladies virales humaines, leurs signes cliniques, leur mode de réplication, leur détection et identification, ainsi que leur prophylaxie.
La partie Parasitologie aborde les principaux parasites humains, les maladies associées ainsi que les méthodes de diagnostic utilisées au laboratoire et les méthodes de prévention. Il en est de même pour la partie Introduction à la mycologie. Le cours est complété par des travaux pratiques en biotechnologies - biologie moléculaire appliqués à la microbiologie médicale.
  Contenu détaillé par chapitre:
  1. Introduction
1.1. Introduction générale
1.2. Introduction à la virologie - Virologie générale
1.3. Introduction à la parasitologie - parasitologie générale
1.4.Introduction à la mycologie
1.5. Introduction - Agent transmissible non conventionnel
2. Maladies infectieuses par système
2.1. Peau, muqueuses et phanères
2.2. Système nerveux
2.3. Système respiratoire
2.4. Système urinaire et système génital
2.5. Système digestif
2.6. Les hépatites
2.7. Les maladies systémiques
Travaux pratiques
Sécurité et hygiène
Orienté vers la biosécurité, ce cours vise à assurer une information correcte des étudiants sur les dangers principalement de nature biologique présents dans les laboratoires de biologie médicale ou de recherche. Il donne les bases pour pouvoir évaluer les risques et donc mettre en œuvre leur gestion. Il informe sur les différents types d'équipements de protection individuels et collectifs présents dans les laboratoires et les pratiques opérationnelles que le technologue se doit de mettre en place pour assurer sa propre sécurité, celle de son entourage personnel et professionnel ainsi que celle l'environnement.
Enfin, un cours est consacré à la sécurité incendie avec la collaboration de l'unité de prévention des pompiers.
Acquis d'apprentissage (objectifs d'apprentissage) de l'unité d'enseignement :
Microbiologie : parasitologie et virologie
Définir et décrire les virus et les parasites humains, les maladies associées ainsi que l'ensemble des méthodes de diagnostic et leur interprétation ( 1.1, 1.2, 1.3, 1.4, 1.5, 1.6)
 
Etablir l'approche à envisager pour réaliser un diagnostic microbiologique à partir de différents types de prélèvements en justifiant et argumentant ses choix (4.1, 4.2, 4.3, 4.4, 6.1, 6.2, 6.3, 6.4)
Mettre en place une démarche diagnostique logique pour les différents types d'échantillons pouvant être rencontrés dans un laboratoire de Microbiologie, en basant ses choix sur les avantages/inconvénients/ limites de chaque technique (4.1, 4.2, 4.3, 4.4, 6.1, 6.2, 6.3, 6.4)
Mettre en pratique les connaissances théoriques pour comprendre les analyses et aboutir à un diagnostic  (4.1, 4.2, 4.3, 4.4, 6.1, 6.2, 6.3, 6.4)
Evaluer et interpréter les résultats obtenus par les analyses microbiologiques afin d'orienter le diagnostic (4.1, 4.2, 4.3, 4.4, 6.1, 6.2, 6.3, 6.4)
Travailler dans des conditions aseptiques, avec du matériel infectieux (4.1, 4.2, 4.3, 4.4, 6.1, 6.2, 6.3, 6.4)
Réaliser les gestes précis exigés par la manipulation de matériel infectieux et de matériel génétique (4.1, 4.2, 4.3, 4.4, 6.1, 6.2, 6.3, 6.4)
Respecter les consignes de sécurité et d'hygiène (4.1, 4.2, 4.3, 4.4, 6.1, 6.2, 6.3, 6.4)
Rédiger un rapport (4.1, 4.2, 4.3, 4.4, 6.1, 6.2, 6.3, 6.4)
Réaliser les manipulations microbiologiques de manière autonome et en interpréter les résultats (4.1, 4.2, 4.3, 4.4, 6.1, 6.2, 6.3, 6.4)
Suivre un mode opératoire et le mettre en œuvre (4.1, 4.2, 4.3, 4.4, 6.1, 6.2, 6.3, 6.4)
Appliquer, avec réflexion, les modes opératoires (4.1, 4.2, 4.3, 4.4, 6.1, 6.2, 6.3, 6.4)
Sécurité et hygiène
Définir le risque biologique (infections acquises en laboratoire et voies d'infection) dans le but de mieux comprendre l'importance de la biosécurité au laboratoire et de l'adoption de bonnes pratiques.
Evaluer des risques en étant informé sur :


  • les classes de risques
  • les modifications génétiques-potentialisation liée à l'insert
  • les risques spécifiques (cultures cellulaires; échantillons humains)
  • la nature de l'activité
Gérer et prévenir les risques en vous basant sur vos connaissances :


  • des méthodes de protection individuelle ou collective et principes de manipulation en laboratoire
  • des méthodes d'inactivation physique et chimique des agents biologiques
  • de la gestion des déchets en laboratoire
  • du transport des agents biologiques
Les compétences travaillées dans ce cours sont les suivantes : 
1.1 Participer activement à l'actualisation de ses connaissances et acquis
1.3 Développer ses aptitudes d'analyse, de curiosité intellectuelle et de responsabilité
1.5 Adopter un comportement responsable et citoyen
2.3 Respecter la législation et les réglementations
3.4 Respecter les normes, les procédures et les codes de bonne pratique
Savoirs et compétences prérequis :
Microbiologie : parasitologie et virologie
Biologie - Microbiologie (1er et 2ème Bac) - Biologie moléculaire, biotechnologie, génie génétique - Immunologie, techniques immunologiques et sérologie - Hygiène (pictogrammes de sécurité, EPI, ES, risques biologiques, ...)
Règles de bonnes pratiques en laboratoire
Unités de volume - dilutions - utilisation d'un microscope
Sécurité et hygiène
Cours d'hygiène et notions de base de sécurité en laboratoire acquises lors des TPs
 
Activités d'apprentissage prévues et méthodes d'enseignement :
Microbiologie : parasitologie et virologie
Cours ex cathera
Sécurité et hygiène
Cours ex-cathédra 
Visualisation de vidéos issues du cours en ligne du gouvernement Canadien: Biosécurité et biosureté en laboratoire 
https://training-formation.phac-aspc.gc.ca/course/index.php?categoryid=2&lang=fr

Exercices de réflexion 
Mode d'enseignement (présentiel ; enseignement à distance) :
Microbiologie : parasitologie et virologie
Présentiel
Activités en laboratoire
Observation de pratiques
Résolution de problèmes
Travaux en autonomie des étudiants
 
Sécurité et hygiène
Présentiel
Lectures recommandées ou obligatoires et notes de cours :
Microbiologie : parasitologie et virologie
Grosjean J. et al. (2011) Bactériologie et virologie pratique (2ème édition révisée - De Boeck)
Guillaume V. (2009) Parasitologie sanguine (Biologie médicale pratique - De Boeck)
Guillaume V. (2009) Mycologie (Biologie médicale pratique - De Boeck)
Guillaume V. (2007) Parasitologie (Biologie médicale pratique - De Boeck)
Association française des enseignants de parasitologie et mycologie médicales (2007) Parasitoses et mycoses des régions tempérées et tropicales (1ère édition - Connaissances et pratique - Masson)
Prescott L., Harley J. & Klein D. (2003) Microbiologie (2ème édition française - De Boeck)
Fleury H. (2002) Virologie humaine (4èmé édition - Connaissances et pratique - Masson)
http://www.virology-online.com/presentations/index.htm
http://www.microbes-edu.org/
http://bioimage.free.fr/
Kabisa (computer based tutorial for tropical and subtropical medicine) à télécharger sur le site de l'Institut de Médecine Tropicale d'Anvers : http://www.itg.be/itg/GeneralSite/Default.aspx?WPID=513&L=F
Sécurité et hygiène
Powerpoints 
 
Modalités d'évaluation et critères :
La note globale de l'unité d'enseignement est une moyenne pondérée des résultats obtenus dans les différentes activités d'apprentissage qui la composent : Microbiologie : virologie/parasitologie (80%) - Sécurité et Hygiène (20%)
L'unité est réussie avec une note minimale de 10/20 pour chaque activité d'apprentissage
Microbiologie : parasitologie et virologie
Interrogation partielle portant sur le premier chapitre (15% de la cote). Date à convenir avec les étudiants.
Examen final comptant pour 85% de la cote.
Sécurité et hygiène
Examen écrit basé principalement sur des analyses de situations pratiques.
Stage(s) :
Remarques organisationnelles :
Contacts :
Microbiologie : parasitologie et virologie
olivier.waroux@hech.be 
Sécurité et hygiène
sandra.florquin@hech.be
Notes en ligne :
Sécurité et hygiène
cours sécurité hygiène
Ce powerpoint est le support principal du cours oral.
sécurité incendie
Powerpoint réalisé par les pompiers de Liege relatif à la sécurité dans les laboratoires.
transport matières biologiques
Powerpoint complémentaire au cours sur le transport des matières biologiques.